转录组万博意甲(Transcriptome sequencing)可全面快速地获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的几乎所有的转录本及基因序列,可以用于研究基因结构和基因功能、可变剪接和新转录本预测等。目前,转录组万博意甲已经被广泛应用于动物优良基因筛选等方面。

技术路线

技术参数

样品要求
万博意甲策略
项目周期
样品类型:RNA
样品总量:≥1.5ug
样品浓度:50ng/ul
万博意甲平台:HiSeq PE100
万博意甲文库:小片段200bp RNA文库
推荐数据量:4-6 Gb
45个工作日
(标准分析)

相关案例

松树生殖器官发育的转录组研究

目前有关裸子植物生殖器官结构的研究很少,特别是对雌雄异体的两性生殖结构的研究更少。研究人员以不同生长阶段的松树性球果样品为材料,利用转录组万博意甲技术和60K芯片检测技术对球果不同发育阶段的基因表达进行了分析。结果表明,两性球果中雄性结构的转录组和雌性球果中雄性结构的转录组总体上看是有很大相似性的;在幼年期,一些MADS-box基因在两性球果中的表达与在雄性球果中的表达相似,虽然后来这些基因表达发生了改变,但在组织结构上,两性球果中的雄性结构和正常雄性球果的结构仍难以区分。

图1 松树球果中相关基因的表达模式分析

参考文献

Niu S, Yuan H, Sun X, et al. A transcriptomics investigation into pine reproductive organ development[J]. New Phytologist, 2015.